HTMLモードはブラウザの標準機能のみを使用して実装しているため、ActiveXモードとは機能の差がいくつかあります。以下に機能の違いを示します。
ActiveXモードは利用できません。
| 種別 | 機能 | ActiveXモード | HTMLモード | 
|---|---|---|---|
| ディスプレイ | F6680ディスプレイエミュレーション | ○ | ○*1 | 
| 磁気カード・バーコード入力 | ○ | ○ | |
| F6683グラフィック表示 | ○ | ○*2 | |
| ローカルコピー | ○ | ○ | |
| 画面印刷 | ○ | ○*8 | |
| フルスクリーン表示 | ○ | ○*3 | |
| ウィンドウ表示位置設定 | ○ | ○ | |
| JEF拡張漢字表示 | ○ | ○ | |
| JapanistによるJEF入力 | ○ | × | |
| ファイル転送 | ○ | ○*4、*5 | |
| マクロ | ○ | ○ | |
| 即時変更 | ○ | ○*6、*8 | |
| 3270ディスプレイエミュレーション | ○ | ○*7 | |
| 3270ファイル転送 | ○ | × | |
| プリンタ | F6685プリンタエミュレーション | ○ | ○*8 | 
| FMLBP114端末プリンタエミュレーション | ○ | ○*8 | |
| F6671プリンタエミュレーション | ○ | ○*8 | |
| 3270プリンタエミュレーション | ○ | × | 
○:サポート
×: 使用できません。
*1:IEアドオンを使用しない場合、一部キーボード入力に制約があります。
    ・EnterキーとテンキーのEnterは区別できません。
    ・テンキーをエミュレータ機能キーに割り当てて使用することはできません。
    (→「A.14 HTMLモードのブラウザごとのキー比較」参照)
*2:Internet Explorer 8を使用時は利用できません。(HTML5対応ブラウザが必要です)
*3:ブラウザのフルスクリーン機能に従った表示範囲になります。
*4:IEアドオンを使用しない場合、パラメータリストファイルによる転送はできません。
*5:スマートデバイスの場合、ファイル転送機能は利用できません。
*6:エミュレータツールバーからのプロファイル選択による即時変更のみです。
*7:一部キーボード入力に制約があります。
    ・EnterキーとテンキーのEnterは区別できません。
    ・テンキーをエミュレータ機能キーに割り当てて使用することはできません。
    (→「B.11 HTMLモードのブラウザごとのキー比較」参照)
*8:IEアドオンを使用する場合に利用できます。
    (→「A.12 HTMLモードとActiveXモードの機能比較」参照)