実行環境となるサーバーへアプリケーションを配備するには、まず、Eclipseなどの開発ツールのエクスポート機能によりwarファイルを作成してください。
warファイルを作成後、実行環境となるサーバーへSFTPなどで転送し、サーバー上でGlassFishのasadminコマンドを使用して配備してください。
詳細は、“Interstage Application Server GlassFish 設計・構築・運用ガイド”を参照してください。