登録されているユーザ情報やグループ情報は、移行の前後で違いがあってはいけません。
移行前に環境変数RN_WORKDIRを指定している場合、移行作業の終了後、環境変数RN_WORKDIRに指定されているディレクトリ、およびその配下のユーザ名のディレクトリの権限を確認してください。
Navigator Serverプロセスの実効ユーザが読み込み、書き込みのできる権限(UNIXではこれに加えて実行のできる権限)が設定されていない場合は、設定してください。
また、RN_WORKDIRに新たなディレクトリを指定する場合(または移行後にRN_WORIDIRの指定をしない場合)は、OS認証時に指定していたディレクトリ、およびその配下のユーザ名のディレクトリは、不用となりますので削除してください。