クライアントアプリケーションがサーバアプリケーションと通信を行う際、最初にコネクション接続を行います。サーバマシンが未起動の状態などの理由でパケットが接続先に到達できない場合、一般的にコネクション接続がタイムアウトするまでに3分程度かかります(タイムアウト時間はOSの制御に依存します)。
コネクション接続が完了するまではクライアントタイムアウト機能が有効となりませんので、通信を行う際にサーバマシン未起動状態などの可能性がある場合は、コネクション接続がタイムアウトするまでの時間を考慮した運用を行ってください。