SCIGRESS  機能

 Workspace |  Spreadsheet |  計算モジュール |  外部プログラムインタフェース |  入出力ファイル形式変換 |  化学構造データベース検索機能 |  化学構造式エディタ連携機能 

Workspace（分子描画/解析結果表示）

Workspaceは、分子を構築するためのモジュールです。マウスだけで簡単に構築可能です。更に計算結果により、分子軌道や静電ポテンシャル図、UV-Visスペクトル、IRスペクトルを表示します。

Spreadsheet（自動バッチ計算GUI）

• Spreadsheetは、実験室で合成した膨大な化合物や計算結果を一覧にして管理できます。
• 求めたいプロパティをあらかじめ指定することにより、複数化合物に対し一括して自動計算を実行できます。
• データのソートやグラフ化、直線回帰が簡単に行えます。データを論文投稿に適したフォーマットで出力できます。
• 計算の手間を大幅に省くことができます。

計算モジュール

Mechanics

分子力学法を用いて分子の最適構造などを計算するモジュールです。

Dynamics

分子動力学法のソフトウェアで、分子モデルの挙動をシミュレートできます。

Extended Huckel

シュレディンガー方程式を解く経験的な分子軌道計算法です。

ZINDO

半経験的分子軌道法のプログラムです。

MO-G

半経験的分子軌道法のプログラムです。

MO-S

有機分子の紫外・可視スペクトルを精度良く求めることができます。

CONFLEX3

環構造および直鎖構造を持つフレキシブルな分子の配座異性体の最適化構造を探索できます。

MD-ME

古典的分子動力学法に基づき、無機物や有機物から構成されるさまざまな材料の設計を支援するためのソフトウェアです。

外部プログラムインタフェース

• 文部科学省の「革新的シミュレーションソフトウェアの研究開発」プロジェクトで開発された密度汎関数法ソフトウェア「PHASE」を利用するためのインタフェースを用意しています。
  PHASE I/Fはアドバンスソフト株式会社が開発・販売する「Advance/PHASE V2.5」にも対応しています。
• SCM社が開発・販売する密度汎関数法ソフトウェア「ADF」を利用するためのインタフェースを用意しています。 SCIGRESS V2では、従来のADFインタフェースの機能に加え、周期境界構造計算「ADF BAND」のインタフェースを用意しています。
• コンフレックス株式会社が開発・販売する配座空間探索ソフトウェア「CONFLEX 6」を利用するためのインタフェースを用意しています。
• SCC社が開発・販売する半経験的分子軌道法ソフトウェア「MOPAC2007」を利用するためのインタフェースを用意しています。
• Iowa州立大学のGordon research groupを中心に開発されている非経験的分子軌道法、密度汎関数法ソフトウェア「GAMESS」を利用するためのインタフェースを用意しています。

[PHASEインタフェース]

入出力ファイル形式変換

SCIGRESSで用いているデータ形式と他のアプリケーションなどのファイル形式との間で形式を変換します。

SCIGRESSのファイル形式から以下のデータ形式を作成できます。

• Tribble形式
• Brookhaven形式(PDB)
• MDL Mol形式
• SYBYL Mol形式

以下のデータ形式からSCIGRESSファイル形式を作成できます。

• Brookhaven形式（PDB）
• MDL Mol形式
• Shelx形式
• Cambridge形式
• Crystal Structure形式
• SYBYL Mol形式
• Gaussian fchk形式

化学構造データベース検索機能

• SCIGRESS上で化学構造データベースを検索するための新機能です。
• V2.0ではCambridgeSoft社のデータベースChemFinderに対応しています。
• SCIGRESSのデータベースAPI2を用いることで、任意の化学構造データベースをSCIGRESSから利用することができます（別途プログラム開発が必要）。

[検索結果表示画面]

化学構造式エディタ連携機能

計算対象の分子構造を化学構造式エディタで作図するための機能です。
CambridgeSoft社の構造式描画ソフトウェアChemDrawがインストールされている環境ではChemDrawと連携することができます。

[化学構造式エディタ]

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